Вчена рада Інституту створюється при директорі інституту як дорадчий орган.

Однією з основних задач Вченої ради є формування творчого світогляду і методології в наукових дослідженнях працівників інституту, виховання молодих наукових кадрів за фахом "Очні хвороби".

Основні функції Вченої ради Інституту:

• Обговорення і затвердження основних напрямків наукової і лікувальної діяльності інституту
• Обговорення запитів на фінансування нових науково-дослідних робіт (НДР), які подаються на різного рівня конкурси
• Обговорення і оцінка діяльності клінічних відділень, лабораторій, окремих наукових співробітників і допоміжного персоналу інституту
• Обговорення результатів закінчених та перехідних НДР
• Обговорення планів і звітів керівників республіканських науково-методичних центрів, які утворені і діють на базі інституту
• Розгляд і затвердження пропозицій щодо впровадження в практику охорони здоров'я результатів НДР, планів видання наукових праць інституту
• Розгляд індівідуальних планів дисертаційних робіт і контроль за їх виконанням, планів роботи аспірантів і молодих науковців
• Попередня апробація закінчених докторських і кандидатських дисертаційних робіт аспірантів і наукових співробітників інституту та сторонніх організацій
• Затвердження протоколу атестаційної комісії по атестації аспірантів, клінічних ординаторів, стажерів, які проходять навчання в інституті
• Проведення конкурсів на заміщення вакантних посад керівників відділень, лабораторій і наукових співробітників
• Обговорення матеріалів щодо присвоєння науковим співробітникам інституту вчених звань та висунення їх наукових робіт на присвоєння різних премій
• Обговорення рецензій на наукові розробки, які надійшли для відгуку із сторонніх організацій

СКЛАД Вченої ради Інституту

• ЛОГАЙ Іван Михайлович (голова)
  професор, доктор медичних наук, Заслужений діяч науки і техніки України, директор інституту
• ВІТ Валерій Вікторович (заступник голови)
  професор, доктор медичних наук, заступник директора по науці
• МОІСЕЄВА Ніна Миколаївна (вчений секретар)
  кандидат біологічних наук, старший науковий співробітник
• БОБРОВА Надія Федорівна
  доктор медичних наук, старший науковий співробітник, керівник відділення дитячої офтальмології
• БУЙКО Олександр Сергійович
  професор, доктор медичних наук, ведучий науковий співробітник відділення офтальмоонкології
• КАШИНЦЕВА Людмила Терентіївна
  професор, доктор медичних наук. Заслужений діяч науки і техніки України, головний науковий співробітник відділення глаукоми і офтальмоендокринології
• КРАСНОВИД Тетяна Андріївна
  доктор медичних наук, старший науковий співробітник, керівник відділення пошкоджень очей
• ЛЕВТЮХ Любомир Іванович
  кандидат медичних наук, старший науковий співробітник, керівник організаційно - методичного відділу
• ЛЕУС Микола Федорович
  професор, доктор медичних наук, керівник лабораторії біохімії
• ЛИННИК Леонід Андрійович
  професор, доктор медичних наук, керівник лабораторії застосування лазерів в офтальмології
• ЛОТОШ Тамара Дмитрівна
  кандидат біологічних наук, старший науковий співробітник лабораторії фармакології тканинних препаратів
• ОСТАШЕВСЬКИЙ Віктор Леонардович
  кандидат медичних наук, науковий співробітник відділення патології рогівки
• ПЕРЕТЯГІН Олег Анатольович
  кандидат медичних наук, доцент, керівник відділення глаукоми і офтальмоендокринології
• ПОНОМАРЧУК Валерій Семенович
  доктор медичних наук, страший науковий співробітник, керівник групи функціональних методів дослідження
• ПУЧКІВСЬКА Надія Олександрівна
  академік НАН і АМН України, Заслужений діяч науки і техніки України, професор-консультант
• РОЗЕНБЕРГ Володимир Аркадійович
  доктор медичних наук, старший науковий співробітник, керівник відділу медико-технічних розробок
• САВКО Валентин Валентинович
  доктор медичних наук, старший науковий співробітник, керівник відділення увеїтів
• СКРИННИК Олександр Васильович
  доктор медичних наук, старший науковий співробітник, керівник лабораторії ультразвуку
• СОТНІКОВА Олена Петрівна
  доктор медичних наук, старший науковий співробітник, керівник лабораторії фармакології тканинних препаратів
• СТОЙЛОВСЬКА Олена Георгіївна
  старший науковий співробітник відділу наукової інформаці
• ТЕРЕНТЬЄВА Людмила Сергіївна
  професор, доктор медичних наук, керівник відділення офтальмоонкології
• ЯКИМЕНКО Станислав Андрійович
  професор, доктор медичних наук, керівник відділення опіків очей